1840年，一个风雨交加的夜晚，泉州知府萧玉堂夫妇中年得子，不料生下一个肉团。萧夫人惊骇而亡，萧玉堂悲愤交加，命仆人将这一肉团丢弃。
一药翁飘然而至剖开胞衣，一声惊天动地的啼哭，虚云就这样来到了人间。古岩八岁进学堂，悟性极高。一天他结识了小和尚，对佛学产生兴趣。
萧玉堂把小和尚师徒请到家里想羞辱他们，却没得逞。奶奶临终前关心古岩的亲事，父亲帮古岩定亲。
百年虚云第2集剧情介绍古岩(尹治饰)回到泉州来到开元寺向明心法师请教出家的事，萧玉堂担心古岩会出家就命荣管家叫古岩回家，跟他商量娶妻的事。古岩不同意娶妻并向父亲承认自己想出家，对充满杀戮、灾难重重的世界很失望，对功名利禄名誉得失毫无兴趣，古岩的想法令萧玉堂大怒，他将古岩关进书房。
仕奇听说娥英近期要与古岩完婚很不甘心，他买通无赖到萧府闹事。仕奇不服古岩一人可以独占两女便请父亲帮自己娶娥英，却遭到父亲的拒绝。古岩见自己出家的想法令父亲如此伤心便答应娶亲不出家了，结婚前娥英觉得自己配不上古岩，想要上吊自杀被仕奇拦下，他向田父承认谣言是自己致使散播的。
大婚当晚，王氏让古岩先与湘月(胡小婷饰)圆房，古岩不愿意，进入洞房后便坐在地上打坐。
百年虚云第3集剧情介绍大婚当晚，古岩(尹治饰)坚持打坐没有和湘月(胡小婷饰)、娥英两人圆房，娥英失声痛哭。第二天一早古岩向湘月、娥英两人摊牌，表示自己迟早要出家事佛，成亲之事实是难违父命，希望得到二人理解，知书达礼的娥英劝湘月不要灰心，两人决定用真情感动一心向佛的古岩。
百年虚云剧照
官兵因谭仕奇参加太平军一案冲到谭府抄家，不明所以的谭大人据理力争无果，得知儿子已死的消息后谭大人痛不欲生，古岩更是觉得难以相信。眼看古岩成亲已有两年，娥英希望古岩和自己圆房却被婉言拒绝，随后古岩连夜离家出走。
百年虚云第二天，萧玉堂得知古岩出走的消息后大怒，吩咐下人们分头去找。古岩一路奔波来到寺庙请求剃度出家却被常开大师拒绝，为了出家古岩决定长跪寺庙门前以示决心。
百年虚云第4集剧情介绍古岩(尹治饰)一直跪在涌泉寺前请求大师收自己和富国为徒，经过考验常开大师同意收古岩和富国为徒并为他们剃度，出家第一天不空师傅为他们讲解了寺院的礼仪和规矩。
富国见出家的日子辛苦不堪，很后悔当初和古岩一起出家当和尚便夜晚翻墙伺机逃走，不料被师父发现。
娥英得知古岩和富国在涌泉寺便一人前往寻找古岩，找到古岩后见古岩出家态度坚决很伤心。
